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《甄嬛傳》以及《如懿傳》的小說中并沒有提到甄嬛的去世原因，不過在歷史上，甄嬛的原型鈕祜祿氏是在86歲時因病去世。
乾隆四十二年（1777）正月初八日，乾隆帝奉皇太后到圓明園。皇太后駐蹕圓明園期間，幾乎都住在長春仙館，因為這里距皇帝處理政務的正大光明殿和皇帝的寢宮九洲清宴都很近，便于皇帝給皇太后問安侍膳。
正月初九日，乾隆帝陪著皇太后在九洲清宴一邊進膳，一邊觀看節(jié)日的燈火，妃嬪和皇子、皇孫們也都陪侍在旁，“五世同堂，同伸歡忭”。乾隆帝見皇太后“慈顏康豫，不減常年”，非常高興。這一年，皇太后86歲，乾隆帝67歲。他想皇太后90歲大壽時，自己也是71歲的老人了。那時一定要為皇太后更隆重地慶祝一番。
正月十四日行完祈谷大祀后，乾隆帝聞知皇太后身體不豫，趕到長春仙館看望，當天晚上還陪著皇太后在同樂園進晚膳。皇太后當時的病情并不重，只是偶爾違和，抓緊調(diào)治后，病情大有好轉(zhuǎn)。可是沒過幾天，病情出現(xiàn)反復，而且較前加重。皇太后不想把病情轉(zhuǎn)重的事讓皇帝知道，怕引起兒子煩心，影響理政，所以在皇帝問安時，故意談笑如常。
到正月二十二日，皇太后病情已十分嚴重，這一天乾隆帝看望了母親兩次。這天深夜，皇太后已進入彌留狀態(tài)。乾隆帝守候在旁。到了二十三日子刻，皇太后“痰忽上涌，遂于丑刻病逝”，終年86歲。舉國致哀，尊謚號定為“孝圣慈宣康惠敦和誠徽仁穆敬天光圣憲皇后”（因此后世稱其為孝圣憲皇后），葬于泰東陵。
